Le principe de base de la séparation de l'air repose sur la rectification cryogénique pour condenser l'air en liquide et séparer ses composants selon leur température d'évaporation. La tour de rectification à deux étages permet d'obtenir simultanément de l'azote et de l'oxygène purs en haut et en bas de la tour supérieure. Il est également possible d'extraire de l'oxygène et de l'azote liquides respectivement du côté évaporation et du côté condensation du refroidisseur principal. La séparation de l'air dans la tour de rectification se déroule en deux étapes : l'air est d'abord séparé dans la tour inférieure pour obtenir de l'azote liquide et, simultanément, de l'air liquide enrichi en oxygène. Cet air liquide enrichi en oxygène est ensuite envoyé dans la tour supérieure pour y être rectifié afin d'obtenir de l'oxygène et de l'azote purs. La tour supérieure est divisée en deux sections : la section supérieure, délimitée par l'entrée air-liquide, est la section de rectification. Elle rectifie le gaz ascendant, récupère l'oxygène et purifie l'azote, tandis que la section inférieure est la section de stripage. Elle permet d'éliminer l'azote présent dans le liquide et d'améliorer sa pureté en oxygène.